Основной вид деятельности Палаты экологических аудиторов – защита прав и законных интересов экологических аудиторов и экологических аудиторских организаций в государственных органах Республики Казахстан. В рамках уставной деятельности Палатой экологических аудиторов выполняется общественный мониторинг проектов нормативно-правовых актов, работа по их улучшению путем взаимодействия с государственными органами, работа по повышению эффективности правоприменительной практики и снижению административных барьеров.